種皮
種子的包覆組織可能為種皮，果皮或其他花器的殘留物所構成，大豆種子的包覆組織就是種皮；許多種子的包覆組織卻是果皮，如翅果、穎果、瘦果等類的種子。例如芒果核內含種子，其堅硬的外殼，乃是內果皮。
小麥種子成熟後潁果與內、外潁分開，因此種子的包覆組織由相連的果皮和種皮組成，兩種組織無法分開，是為潁果。又如水稻成熟的潁果與外殼緊密連接，該外殼即是花器的內、外潁，其基部又附有兩片短小的護潁，整個稱為穀粒。去包覆組織之後的潁果，俗稱糙米。無論是果皮或種皮，其遺傳質皆與母體一樣，是
2N。種皮主要由珠被發育而成，珠被一般可分為內珠被與
(inner integument) 外珠被(outer integument)。珠被、珠被基部的合點(chalaza)、珠柄與珠被相連處的珠脊(raphe)等，在種子充分發育之後，皆併入種皮組織之中。這些組織乃由母體細胞發育而來，因此，種皮具有與母體完全相同的遺傳組成，不會表現出花粉帶來的父本特徵。此為種皮所以在植物自然分類上有很大應用價值的原因，而其基礎則在於種皮的構造相當複雜，而且具有植物演化上的意義。珠被在受精之際即開始進行細胞分裂，分裂之後再延行細胞增大或者分化。分裂、增大、分化這三種細胞的活動先後次序及強度，在各種植物又各自有不同的組合方式，導致種皮
(至少在雙子葉植物) 的構造成為科的特徵。例如平行分裂(periclinal division，即分裂面與珠被平行) 的結果可以增加珠被細胞層數，而垂直(anticlinal)分裂則增加各層細胞的數目，細胞擴大可以增加珠被的表面積；擴大的方式若為radial的增長，則可以形成柵狀細胞，若為tangential增長，則可以形成管狀或漏斗狀的細胞，若四面均勻地擴大，則形成圓球狀細胞。細胞分化的結果或成為表皮細胞層，或成為薄璧細胞層，也可能分化成維管束鞘，或向外生成種皮附屬物，如翅、毛、假種皮
(aril)等。種皮可分化出各種細胞，如
tannin cell，常出現種皮之外層細胞，細胞液內含有單寧如polyphenol等二次代謝物，據云可以保護種子，避免昆蟲、草食動物、微生物的侵害，也可能與種子硬實、休眠有關。外層細胞也可能分化成mucilage cell，遇水即分泌黏液。Crystal cell 則可能出現於種皮各層細胞，其內可能含有氧化鈣(如Geraniacece、 Oxalidaceae、 Malvaceae、Vilaceae、Rutaceae等)、碳酸鈣(Euphobiaceae)或矽粒(如單子葉植物的Commelinaceae、 Zingiberales)。
此外種皮細胞也可能分化成
tracheidal cell、 cork cell或 fiber cell。 有時種皮外觀如翅者稱為具翅種子(winged seed, pterospermous)，如台灣肖楠、台灣二葉松、台灣杉、港口馬兜鈴、馬利筋、蒜香藤、穿山龍、楓香、紫葳、大葉桃花心木、水團花、華八仙、台灣泡桐、刺茄、大頭茶、薄葉野山藥、台灣百合等的種子(楊勝任、薛雅文 2002)。
種子成熟之後，水份急速喪失，代謝活動也遽降，這些種皮細胞層也隨之壓縮，成為成一般教科書所謂的種皮(testa、seed coat)。
種皮實際上包含兩個組織，由外珠被衍生者稱為表種皮(testa)，而由內珠被衍生的稱為裏種皮(tegmen)。表種皮與裏種皮又各自有若干細胞層，其中有一或二層會分化成厚壁細胞。依照厚壁細胞層的所在，Corner將雙子葉植物種子的種皮分成七類：
外表種皮型(exo-testal seed coats)
此型種子種皮的機械
(厚壁) 層源自外珠被的外皮層。具有此型種皮的植物種頗多，尤其常見於於合花瓣(Sympetalae)單珠被(即胚珠僅有一層珠被，無內外之分者) 的植物。Begoniaceae、Berberidaceae(小檗科)、Centrospermae、豆科、Melianthaceae、Rhamnaceae(鼠李科)及Sapinadaceae等皆為外種皮型種子。中表種皮型(meso-testal seed coats)
此型種子其種皮機械層源自外珠被的中層細胞，具有此型特徵的植物見諸
Hamamelidaceae(金縷梅科)、Lecythidaceae、Myrtaceae(桃金孃科)、Rosaceae、Theaceae、 Cucurbitaceae 及Paeoniaceae等。內表種皮型(endo-teatal seed coats)
由外珠被的內層組織衍生出種皮機械層的種子屬之。此層細胞通常單層，但亦有多層者，見諸
Magnoliaceae、Degeneriaceae和Vitaceae。內種皮細胞的形狀及內容物有多種，例如在Myristicaceae(肉豆蔻科)為柵狀層，在Grossulariaceae為Cuboia cell，在Onagtaceae為stellate cells, 在Caura ceae為 lougitudinally elongated cell layer。十字花科種子亦屬此型，其機械層細胞胞壁一邊不增厚，而呈現
U字型。一般以為十字花科與白花菜科(Capparidaceae)為很接近的兩科，但根據種皮的研究，白花菜科種子的機械在於具纖維細胞的外種膜，因此與十字花科者大為不同。此外，就胚之形狀而言，十字花科屬於彎曲型，而白花菜科則屬於線條型，也可以作為兩科不接近的佐證。這層細胞有含有晶體，如在
Geraniaceae、Oxalidaceae、Malvaceae、Violaceae及Rutaceae可以見到草酸鈣的結晶，Commelinaceae、Zingiberales等有矽粒，Euphorbiaceae則含有碳酸鈣 。外裏種皮型(exo-tegmic seed coat)
由內珠被的外層細胞形成機械層的種子屬之。外種膜機械層由其形狀可分為兩大類，有呈各式各樣的纖維狀細胞者（有時細胞伸長，形狀組柵狀細胞），如
Cinaceae(亞麻科)、Celastraceae(衛予科)、Oxalidaceae(醡漿草科)、Mediaceae、Violaceae(堇菜科)、Cappanidaceae、Melpighiaceae(黃褥花科)、Euphorbiaceae(大戟科)，亦有呈Sclereid type者如Malvaceae、Bombacaceae(木棉科)、Clusiaceae、Hypericaceae、Gerudiaceae、及Euphorbiaceae(大戟科) 等皆有例子。此型種子除了外種膜層之外，亦可能同時存在其他機械層，如
Geraniaceae, Meliaceae....等。中裏種皮型(meso-tegmic seed coat)
即由內珠被中層細胞形成機械層者。例子甚少，見諸
Capparidaceae, Chloranthaceae。內裏種皮型(endo-tegmic seed coat)
由內珠被內細胞層形成機械層者，可在
Piperaceae, Saururaceae, Nandinaceae 見到。種皮不分化者
不具有機械層的種皮，常出現於較為進步而具
indehiscent or diupaceous果實之植物的種子，如Aceraceae(槭樹科)、Anacardiaceae(漆樹科)、Cornaceae(山茱萸科)、Menispermaceae(防己科)、Umbelliferace(繖形花科) 等。在一些科中也偶而有會有不分化種皮者，如Celastraceae, Melicieae、Proteauae、Rosaceae、Rutaceae 及Thymelasaceae。但有些indehiscent者亦會具有分化的種皮，如Aguifoliauae、 Burseraceae、Combretaeae、 Elaeocapaceae、Tiliaceae、 Mallotus barbatus 或Bhesa robusta。在掃瞄式電子顯微鏡底下，種皮（或者種殼）表面呈現相當複雜而有規則的立體構圖。目前的研究顯示種子表面的特徵甚為穩定，甚具分類學上的價值特別是對於小種子，傳統方法無法檢測出有用的特徵的植物為然。
種皮（殼）表面的特性可以分四點觀察，即細胞的排列、細胞的形狀、細胞壁的輪廓、以及角質層分泌物等。細胞的排列中特別是氣孔或
trichome在表面上的排列很具分類意義。笠原安夫就日本
57科219屬408種雜草的研究，將種殼表面構造，即鳥瞰面及水平面的特徵，區分出40種型態。其中鳥瞰面細胞排列的型態，包括星狀型、龜甲型、網目型、魚鱗型、屋瓦型、齒牙型、流線型、堤防型、拉鍊型、山脈型、階梯型、織布型等，不一而足。細胞斷面的形狀也可以分為隆起型、突起型、穴狀型、鋸齒型、乳頭形
...等。許多同內種間的表面型態皆很類似，無法區分，但是在Ixeris、Vernoica、Oenothera這幾個屬，種間的變異就很大。
種皮的顏色：大豆為例：黑、褐、黃、綠四類