農業生物多樣性的意涵

農業生物多樣性範圍及於農業生態系，包括栽培的與野生的動植物以及微生物在遺傳上、物種上、以及生態系上的所有組成份；可分成農業環境生物多樣性、作物物種多樣性、以及作物品種 (基因) 多樣性等三個面向。

農業環境生物多樣性

傳統農業的生產力略差，不過就農地生態系而言，基本上仍然維持相對可觀的生物多樣性，包括土壤中的微生物、蚯蚓、以及地上的各種動物、雜草等，可說是較可持久經營的系統。近代農藥化肥的使用，對於農業棲地生物多樣性的破壞很大。目前所推廣的自然農法、生態農村、生物動態農法、永久農業、有機農業，以及改良自現代農法的低投入農業等，或通稱為另類農法，乃是學習傳統小農農法的方式為基礎而加以修改，此等方法強調恢復健康的土壤，增加土攘有機質，長期施行後應該會有效地提升生物多樣性。

作物物種多樣性

傳統農耕技術經過相當長期的演化，雖然對於自然生態系統有所改變，基本上農業仍是穩定、小型而多樣、以及具有韌性的，是可永續經營，而且可自給自足的。在市場經濟上，大農制通常講求生產成本的降低，其資金的投入大，作物種類少。這種方式會使得市場經濟容易影響的小農的收入，對小農相當不利。

作物品種 (基因) 多樣性

統農業生產體系由於農民長期的經營，可以孕育出適合當地各種特殊環境的多樣基因型。以稻為例，依照水的供應、栽培的方式、以及各式的食物需求，東南亞地區過去發展出相當多的稻品種。近代農業藉著灌溉水、化學肥料等新科技的投入，原本相當歧異多樣的農地環境因而單純化，栽培因環境而失敗的風險大減，因此降低對於品種多樣性的要求。然而品種數的減少，會增加環境的風險，因此農民維持多元化的品種，是永續農業的基礎。

詳見農業生物多樣性與農業政策